Stężenie bakterii E. Coli w Odaiba Marine Park dopuszczalną normę przekraczało blisko 20-krotnie. Badania przeprowadzono w trakcie 26 dni między lipcem a wrześniem. Akceptowalne wyniki zanotowano tylko dziesięć razy jeśli chodzi o normy przewidziane dla długodystansowego pływania i sześć razy w przypadku triathlonu.
Organizatorzy zapewniają, że są świadomi problemu, a tak zły wynik badań jest efektem trwających przez 21 dni z rzędu opadów w sierpniu. Z powodu deszczu więcej zanieczyszczonej wody wpływa do tej części Zatoki Tokijskiej. Rozwiązaniem ma być m.in. montaż podwodnych barier.