49-latek zastąpił Luis Filipe Vieirę, który zawiesił pełnienie obowiązków w związku z zatrzymaniem i śledztwem dotyczącym domniemanego oszustwa podatkowego i prania pieniędzy.
W oświadczeniu Benfica poinformowała, że Costa „przejął funkcję prezydenta ze skutkiem natychmiastowym, zgodnie ze statutem klubu. Decyzja ta ma poparcie wszystkich członków zarządu”.
Costa już kilka dni po zakończeniu piłkarskiej kariery, w wieku 36 lat, został wybrany na dyrektora sportowego Benfiki.
Lizbonę opuścił w 1994 roku, po wywalczeniu mistrzostwa, a wcześniej Pucharu Portugalii i przeniósł się do Włoch. W barwach Fiorentiny zdobył dwukrotnie puchar kraju, a z AC Milan - Puchar Europy i mistrzostwo Serie A. Przed sezonem 2006/2007 wrócił do klubu z Lizbony.
W reprezentacji Portugalii rozegrał 94 spotkania i strzelił 26 bramek. Zrezygnował z gry w kadrze po wywalczeniu srebrnego medalu w mistrzostwach Europy w 2004 roku.
Rui Costa, a także m.in. Luis Figo i Fernando Couto, zaliczani byli do "złotego pokolenia" portugalskich piłkarzy - młodzieżowy zespół narodowy (do lat 20) sięgnął po mistrzostwo świata w 1989 i 1991 roku.