W kadrze narodowej Busquets występował od 2009 roku. Rozegrał 143 mecze i strzelił dwa gole.
"To był zaszczyt reprezentować mój kraj i wznieść go na szczyt, być mistrzem świata i Europy, być kapitanem i rozegrać tak wiele meczów. Z mniejszymi lub większymi sukcesami, ale zawsze dając z siebie wszystko i wnosząc swoje ziarnko piasku, (...) walcząc o ten sam cel, z wyjątkowymi, niezapomnianymi i historycznymi doświadczeniami" – napisał 34-letni pomocnik w mediach społecznościowych.
Pod względem liczby występów w reprezentacji Hiszpanii Busquets zajmuje trzecie miejsce. Tylko Sergio Ramos i Iker Casillas rozegrali więcej meczów.
Mundial w Katarze reprezentacja Hiszpanii zaczęła od efektownego zwycięstwa 7:0 nad Kostaryką, ale później nie wygrała już żadnego spotkania. Odpadła w 1/8 finału, gdy przegrała w rzutach karnych z Marokiem.