W zawodowej karierze, w latach 1984-1998, Hernandez stoczył 41 walk, z których 38 wygrał, dwie przegrał, a jedną zremisował.
Pierwszy znaczący sukces, jakim było zdobycie pasa WBA, odniósł w 1991 roku, po zwycięstwie nad Francuzem Danielem Londasem. Czempionem tej organizacji był przez trzy lata, a w 1995 r stanął do pojedynku ze słynnym Oscarem de la Hoyą o tytuł WBO w kategorii lekkiej. Hernandez przegrał i wrócił do niższej wagi. Od 1997 r do niego należał pas WBC w junior lekkiej. Odebrał mu go dopiero, w ostatniej potyczce, kolejny znakomity pięściarz Floyd Mayweather Jr.
Od trzech lat Hernandez chorował na rzadką odmianę raka (choroba zaatakowała szyję i głowę), wykrywaną najczęściej u dzieci.
Mający meksykańskie korzenie Genaro Hernandez pozostawił żonę Lilianę i dwoje dzieci: 19-letnią córkę Amandę i 11-letniego syna Stevena.
