Rozgrywki potrwają od 15 września do 15 grudnia. Rywalizować będzie 48 drużyn, podzielonych na 12 grup. Po dwa najlepsze zespoły awansują do dalszej fazy, dołączą do nich też kluby z trzecich pozycji w grupach Ligi Mistrzów. Finał odbędzie się 9 maja 2012 roku w Bukareszcie.
W najlepszym koszyku znalazły się m.in. finalista poprzedniego sezonu Sporting Braga, Atletico Madryt, Schalke 04 Gelsenkirchen, Tottenham Hotspur, Paris Saint Germain, Anderlecht Bruksela (w składzie z Marcinem Wasilewskim) i PSV Eindhoven (Przemysław Tytoń).
Po raz pierwszy w historii w rundzie grupowej Ligi Europejskiej wystąpią dwa polskie zespoły - Legia Warszawa niespodziewanie wyeliminowała Spartaka Moskwa (2:2 i 3:2), zaś mistrz kraju Wisła Kraków trafił do drugich pod względem ważności kontynentalnych rozgrywek po odpadnięciu w czwartej rundzie kwalifikacji Champions League (1:0 i 1:3 z Apoelem Nikozja).
Podział na koszyki przed losowaniem Ligi Europejskiej:
Koszyk 1 Tottenham Hotspur (Anglia) PSV Eindhoven (Holandia) Atletico Madryt (Hiszpania) Sporting Lizbona (Portugalia) Sporting Braga (Portugalia) Schalke 04 Gelsenkirchen (Niemcy) Dynamo Kijów (Ukraina) Paris Saint Germain (Francja) FC Kopenhaga (Dania) AZ Alkmaar (Holandia) Anderlecht Bruksela (Belgia) Twente Enschede (Holandia)
Koszyk 2 Fulham FC (Anglia) Besiktas Stambuł (Turcja) Hapoel Tel Awiw (Turcja) Metalist Charków (Ukraina) Standard Liege (Belgia) Rubin Kazań (Rosja) Club Brugge (Belgia) AEK Ateny (Grecja) Steaua Bukareszt (Rumunia) Udinese Calcio (Włochy) Athletic Bilbao (Hiszpania) Lazio Rzym (Włochy)
Koszyk 3 FC Salzburg (Austria) Maccabi Hajfa (Izrael) FC Zurich (Szwajcaria) Odense BK (Dania) Lokomotiw Moskwa (Rosja) PAOK Saloniki (Grecja) Birmingham City (Anglia) Stoke City (Anglia) Stade Rennais (Francja) Austria Wiedeń (Austria) Rapid Bukareszt (Rumunia) Hannover 96 (Niemcy)
Koszyk 4 Worskla Połtawa (Ukraina) Wisła Kraków (Polska) FC Vaslui (Rumunia) FC Sion (Szwajcaria) Sturm Graz (Austria) Maccabi Tel Awiw (Izrael) Slovan Bratysława (Słowacja) Legia Warszawa (Polska) NK Maribor (Słowenia) AEK Larnaka (Cypr) Malmoe FF (Szwecja) Shamrock Rovers (Irlandia)
